La nomenclatura oficial de las moléculas alergénicas procedentes de especies animales o vegetales se guía por una regla general:
El nombre del alérgeno se inicia con las tres primeras letras del género al que pertenece el animal o vegetal en cuestión.
Continúa con la primera letra de la especie a la que pertenece el animal o vegetal en cuestión.
Finalmente, se añade un número arábigo, que va creciendo a partir del 1 en función del orden de su identificación.
Por ejemplo, Ole e 1 es el nombre del primer alérgeno identificado en la especie Olea europea (que es el olivo), Ole e 2 es el segundo alérgeno identificado en la misma especie, y así sucesivamente. De igual modo, Der f 1 es el nombre del primer alérgeno identificado en la especie Dermatophagoides farinae (que es un ácaro del polvo doméstico), Der f 2 es el segundo alérgeno identificado en la misma especie, y así sucesivamente.